中科生信云平臺(tái)發(fā)布 全國(guó)多組學(xué)技術(shù)應(yīng)用高端論壇召開(kāi)
分析測(cè)試百科網(wǎng)訊 2019年8月8日，由上海中科新生命生物科技有限公司主辦的“第一屆全國(guó)多組學(xué)技術(shù)及應(yīng)用高端論壇暨中科新生命生信培訓(xùn)班”在上海舉行。本次論壇展示了蛋白質(zhì)組和代謝組在多組學(xué)和生命大數(shù)據(jù)背景下的最新研究進(jìn)展，促進(jìn)行業(yè)內(nèi)各研究領(lǐng)域的交流與合作，加強(qiáng)行業(yè)信息資源的共享與成果轉(zhuǎn)化，邀請(qǐng)了各研究領(lǐng)域的專(zhuān)家、學(xué)者共研蛋白質(zhì)組和代謝組的新技術(shù)和新思路，探討大數(shù)據(jù)背景下的組學(xué)未來(lái)發(fā)展方向。同期，還將舉辦中科新生命十五周年用戶(hù)答謝會(huì)及蛋白質(zhì)組和代謝組生信培訓(xùn)班，吸引了近200位行業(yè)同仁參與。分析測(cè)試百科網(wǎng)作為本次活動(dòng)的支持媒體，全程跟蹤報(bào)道。
第一屆全國(guó)多組學(xué)技術(shù)及應(yīng)用高端論壇現(xiàn)場(chǎng)
中科院上海生命科學(xué)研究院副院長(zhǎng)廖侃研究員致辭
中科新生命成立于2004年，前身是中科院上海生命科學(xué)研究院蛋白質(zhì)組研究分析中心。目前中科新生命已建立科技服務(wù)（蛋白/修飾/代謝研究）、生物醫(yī)藥表征確證及精準(zhǔn)醫(yī)療三大服務(wù)平臺(tái)。中科院上海生命科學(xué)研究院副院長(zhǎng)廖侃在致辭中表示，“中科新生命從最開(kāi)始的數(shù)十人到現(xiàn)在的數(shù)百名員工、年銷(xiāo)售額過(guò)億，我們一步步見(jiàn)證了中科新生命的蓬勃發(fā)展，可喜可賀。我預(yù)祝本次全國(guó)多組學(xué)技術(shù)及應(yīng)用高端論壇順利召開(kāi)，并取得圓滿(mǎn)成功，各參會(huì)人員都能有所收獲。”
中科新生命副總經(jīng)理 謝永明博士
中科新生命副總經(jīng)理謝永明博士上臺(tái)致歡迎辭，對(duì)蒞臨本次活動(dòng)的各位領(lǐng)導(dǎo)和專(zhuān)家表示衷心的感謝。謝永明表示：“隨著系統(tǒng)生物學(xué)與多組學(xué)技術(shù)的快速發(fā)展，恰逢中科新生命成立15周年之際，特別舉辦本次多組學(xué)技術(shù)及應(yīng)用高端論壇暨中科新生命生信培訓(xùn)班，為各領(lǐng)域的行業(yè)專(zhuān)家提供一個(gè)交流平臺(tái)。最后，預(yù)祝本次大會(huì)能圓滿(mǎn)成功，祝前來(lái)參加的各位老師能有所思、有所獲、有所感。”
北美華人質(zhì)譜學(xué)會(huì)主席、普渡大學(xué)終身教授、東南大學(xué)陶緯國(guó)教授
北美華人質(zhì)譜學(xué)會(huì)主席、普渡大學(xué)終身教授、東南大學(xué)陶緯國(guó)教授帶來(lái)題為《Functional Proteomics：from Lab to Clinic》的精彩報(bào)告。
陶緯國(guó)教授介紹了他們實(shí)驗(yàn)室開(kāi)展的關(guān)于西紅柿磷酸化組學(xué)及生物學(xué)信息的研究項(xiàng)目，開(kāi)發(fā)了一系列植物磷酸化的方法，并指出植物的磷酸化程度高于動(dòng)物的磷酸化水平。由于植物的光合作用，其高豐度蛋白、細(xì)胞壁厚度、復(fù)雜代謝物等都是磷酸化研究的難點(diǎn)，對(duì)此，陶緯國(guó)教授研究團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了通用的植物磷酸化分析和蛋白質(zhì)富集方法。
陶教授還詳細(xì)介紹了該實(shí)驗(yàn)室將磷酸化組學(xué)檢測(cè)和外泌體研究相結(jié)合，開(kāi)展了基于外泌體中蛋白質(zhì)磷酸化組變化的腫瘤生物標(biāo)志物的研究，并取得突破性進(jìn)展。
中科院上海營(yíng)養(yǎng)健康研究院博士生導(dǎo)師 尹慧勇研究員
中科院上海營(yíng)養(yǎng)健康研究院博士生導(dǎo)師尹慧勇研究員帶來(lái)題為《代謝組學(xué)與心血管疾病》的精彩報(bào)告。
代謝組學(xué)是系統(tǒng)研究特定生物體系的所有代謝物，其中核磁共振和質(zhì)譜是2種常見(jiàn)的代謝組學(xué)研究技術(shù)。代謝組學(xué)在生物醫(yī)學(xué)研究中主要應(yīng)用于生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)和提供相關(guān)病理機(jī)制的線(xiàn)索。代謝組學(xué)技術(shù)能發(fā)現(xiàn)與某疾病相關(guān)的生物化學(xué)途徑，發(fā)現(xiàn)可用于疾病診斷的生物標(biāo)志物。報(bào)告介紹了基于質(zhì)譜的代謝組學(xué)技術(shù)分析血漿中膽固醇的代謝、脂質(zhì)氧化產(chǎn)物等，研究心血管疾病的靶標(biāo)和風(fēng)險(xiǎn)控制。
鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院肝病研究中心 高潔博士
鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院肝病研究中心的高潔博士帶來(lái)題為《蛋白質(zhì)組學(xué)及代謝組學(xué)聯(lián)合分析肝癌發(fā)生發(fā)展機(jī)制》的精彩報(bào)告。
原發(fā)性肝癌主要指肝細(xì)胞癌，是常見(jiàn)的惡性腫瘤之一，具有惡性度高、預(yù)后差和死亡率高等特點(diǎn)。肝癌的致病原因多樣，目前針對(duì)肝癌有多種治療手段，但療效提高有限。隨著理論及檢測(cè)手段的快速發(fā)展，在基因組學(xué)基礎(chǔ)上衍生的多種組學(xué)的聯(lián)合研究使更深層次地認(rèn)識(shí)、理解多種疾病的發(fā)生、發(fā)展乃至生物進(jìn)化成為可能。
盛京醫(yī)院衛(wèi)生部先天畸形重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室博士生導(dǎo)師 袁正偉教授
盛京醫(yī)院衛(wèi)生部先天畸形重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室博士生導(dǎo)師袁正偉教授帶來(lái)題為《多組學(xué)技術(shù)在出生缺陷早期診斷分子標(biāo)志物篩查的應(yīng)用》的精彩報(bào)告。
出生缺陷是導(dǎo)致全世界范圍內(nèi)產(chǎn)兒和嬰幼兒死亡和兒童殘疾的主要原因。袁正偉教授介紹了使用無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前診斷DNA、蛋白質(zhì)分子標(biāo)志物進(jìn)行篩查的應(yīng)用實(shí)例。
產(chǎn)前診斷分子標(biāo)志物研究，可通過(guò)各種組學(xué)技術(shù)系統(tǒng)篩選不同層次分子標(biāo)志物，生物信息學(xué)技術(shù)對(duì)各種組學(xué)檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行貫通交互分析；在大規(guī)模、多中心的隊(duì)列中能驗(yàn)證分子標(biāo)志物。人工智能技術(shù)可對(duì)分子標(biāo)志物優(yōu)化、篩選并建立計(jì)算機(jī)預(yù)警與診斷模型。
在本次論壇上，中科新生命舉行“中科新生命生物信息學(xué)平臺(tái)”首次發(fā)布會(huì)。該云平臺(tái)解決方案通過(guò)豐富的分析工具接入與精心打磨的交互式分析界面，有效降低科研項(xiàng)目生信分析的難度，提升科研效率，助力研究項(xiàng)目進(jìn)度穩(wěn)定推進(jìn)！
參會(huì)嘉賓共同啟動(dòng)中科生信云平臺(tái)
中科新生命生物信息學(xué)平臺(tái)負(fù)責(zé)人 尚婧
中科新生命生物信息學(xué)平臺(tái)負(fù)責(zé)人尚婧為現(xiàn)場(chǎng)參會(huì)代表介紹“中科生物信息學(xué)云分析平臺(tái)”。
中科生物信息學(xué)云分析平臺(tái)希望能從促進(jìn)生物數(shù)據(jù)的積累和共享，降低計(jì)算資源浪費(fèi)，滿(mǎn)足用戶(hù)個(gè)性化需求，簡(jiǎn)化生物數(shù)據(jù)的再利用和重分析過(guò)程多方面服務(wù)于科研工作者。該平臺(tái)具有云計(jì)算模型，用戶(hù)友好（圖形界面一鍵式操作零基礎(chǔ)生信分析），個(gè)性化定制（按需定制個(gè)性化數(shù)據(jù)展示），安全穩(wěn)定（多層安全防護(hù)/多重?cái)?shù)據(jù)備份/保障數(shù)據(jù)安全完整）等優(yōu)勢(shì)。通過(guò)選擇方法，上傳數(shù)據(jù)，配置參數(shù)，運(yùn)行返回結(jié)果這4步即可進(jìn)行操作。
生信云平臺(tái)后續(xù)還將開(kāi)發(fā)共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)、互作網(wǎng)絡(luò)圖、趨勢(shì)聚類(lèi)等分析工具，二期還將增加基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)等分析流程。
本次會(huì)議上，中科新生命聯(lián)合揚(yáng)州大學(xué)農(nóng)學(xué)院小麥遺傳及分子育種實(shí)驗(yàn)室舉行戰(zhàn)略合作簽約儀式，雙方將在小麥抗病遺傳研究方面進(jìn)行合作，優(yōu)勢(shì)互補(bǔ)，相互支持，共同創(chuàng)新。
中科新生命副總經(jīng)理謝永明博士與揚(yáng)州大學(xué)農(nóng)學(xué)院博士生導(dǎo)師李韜教授共同簽署戰(zhàn)略合作協(xié)議
福建農(nóng)林大學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)研究中心主任 陳偉教授
福建農(nóng)林大學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)研究中心主任陳偉教授帶來(lái)題為《A multilevel investigation to reveal the mechanism of salt tolerance in mangrove Kandelia candel》的精彩報(bào)告。
陳偉教授的報(bào)告主要介紹了通過(guò)多層次研究揭示紅樹(shù)林秋茄（Kandelia candel）耐鹽機(jī)制，包括紅樹(shù)林植物的重要特征，酶活性和代謝物濃度，谷氨酸合成和植物代謝的途徑，鹽脅迫下的秋茄光合作用變化等。研究結(jié)果顯示，在一定量氯化鈉的脅迫下，秋茄光合作用能保持穩(wěn)定，植物能保持生長(zhǎng)，增加的塑性球蛋白可能有助于在鹽脅迫下保持膜的完整性和流動(dòng)性。
中科新生命產(chǎn)品部經(jīng)理 嚴(yán)峻博士
中科新生命產(chǎn)品部經(jīng)理嚴(yán)峻博士帶來(lái)題為《質(zhì)譜組學(xué)技術(shù)梳理》的精彩報(bào)告。
中科新生命成立于2004年，目前提供包括蛋白組，修飾組，非靶向代謝組，靶向代謝組，脂質(zhì)組，多組學(xué)聯(lián)合分析，轉(zhuǎn)錄組及腸道微生物等研究服務(wù)和支持。嚴(yán)峻博士分享了從經(jīng)典的2D-MALDI，同位素標(biāo)記和非標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)，非靶向代謝組、靶向代謝組、脂質(zhì)組學(xué)、多組學(xué)聯(lián)合分析，到最新的DIA全掃描定量蛋白質(zhì)組分析的研究思路和進(jìn)展，并介紹了中科新生命與全國(guó)眾多客戶(hù)在生命科學(xué)、基礎(chǔ)和臨床醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域獲得的研究成果。
揚(yáng)州大學(xué)農(nóng)學(xué)院博士生導(dǎo)師 李韜教授
揚(yáng)州大學(xué)農(nóng)學(xué)院博士生導(dǎo)師李韜教授帶來(lái)題為《轉(zhuǎn)錄和蛋白組學(xué)在小麥抗病遺傳中的應(yīng)用》的精彩報(bào)告，內(nèi)容包括混池轉(zhuǎn)錄組學(xué)在小麥光譜抗性基因定位中的應(yīng)用和混池蛋白組學(xué)挖掘小麥赤霉病抗性/赤霉菌致病性相關(guān)基因。綜合應(yīng)用混池轉(zhuǎn)錄組測(cè)序（BSR-Seq）、SNP芯片以及參考基因組信息，能提高圖位克隆的效率，為候選基因的分析和功能研究奠定了基礎(chǔ)。
通過(guò)在赤霉菌和小麥基因組測(cè)序，以及病原菌致病基因和寄主抗性基因（QTL）定位、挖掘和功能解析研究。通過(guò)轉(zhuǎn)錄組學(xué)應(yīng)用，獲得赤霉菌侵染寄主小麥前后赤霉菌和寄主轉(zhuǎn)錄本變化及其信號(hào)路徑。通過(guò)蛋白組學(xué)應(yīng)用，圍繞赤霉菌侵染小麥前后赤霉菌和小麥種蛋白的積累差異，在寄主方面圍繞赤霉菌主效抗性QTL Fhb1開(kāi)展研究。
重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院精神科主治醫(yī)師 周新雨副研究員
重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院精神科主治醫(yī)師周新雨副研究員帶來(lái)題為《代謝組學(xué)在抑郁癥研究中的應(yīng)用》的精彩報(bào)告，介紹了抑郁癥代謝組學(xué)研究的臨床背景，抑郁癥患者及動(dòng)物模型的代謝組學(xué)研究，全球首個(gè)抑郁癥代謝數(shù)據(jù)庫(kù)的建立。
抑郁癥診斷與治療存在診斷困難，缺乏客觀指標(biāo)，機(jī)制不明、病因不清，無(wú)法尋找新的治療靶點(diǎn)等困惑。代謝組學(xué)是繼基因組學(xué)，蛋白質(zhì)組學(xué)之后，從整體的角度，通過(guò)研究生物體、器官或組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑及其所受內(nèi)在環(huán)境因素影響及隨時(shí)間變化規(guī)律的一門(mén)新興學(xué)科。抑郁癥代謝組學(xué)，可尋找診斷抑郁癥的客觀診斷標(biāo)志物，尋找抑郁癥治療的新靶點(diǎn)，揭示抑郁癥發(fā)生發(fā)展的生物學(xué)機(jī)制。
參會(huì)嘉賓合影
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產(chǎn)品技術(shù)
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