1、功能不同

tRNA：主要是攜帶氨基酸進(jìn)入核糖體，在mRNA指導(dǎo)下合成蛋白質(zhì)。

mRNA：將DNA中的gene轉(zhuǎn)錄成RNA并且運(yùn)送出細(xì)胞核，經(jīng)過剪接修飾后在核糖體上完成翻譯生成蛋白質(zhì)。

rRNA：rRNA是核糖體的主要結(jié)構(gòu)成分，具有肽酰轉(zhuǎn)移酶的活性；為tRNA和多種蛋白質(zhì)合成因子提供結(jié)合位點(diǎn)；在蛋白質(zhì)合成起始時(shí)，參與同mRNA選擇性的結(jié)合以及在肽鏈的延伸中與mRNA結(jié)合。

2、結(jié)構(gòu)不同

tRNA：由一條長70~90個(gè)核苷酸并折疊成三葉草形的短鏈組成的。

mRNA：原核生物mRNA一般5'端有一段不翻譯區(qū)，3'端有一段不翻譯區(qū)，中間是蛋白質(zhì)的編碼區(qū)，一般編碼幾種蛋白質(zhì)，通常mRNA（單鏈）分子自身回折產(chǎn)生許多雙鏈結(jié)構(gòu)。

rRNA：原核生物和真核生物的核糖體均由大、小兩種亞基組成。rRNA是單鏈，它包含不等量的A與U、G與C，但是有廣泛的雙鏈區(qū)域。在雙鏈區(qū)，堿基因氫鍵相連，表現(xiàn)為發(fā)夾式螺旋。

3、含量不同

tRNA：占RNA總量的13~16%左右。

mRNA：只占細(xì)胞總RNA的2%~5%。

rRNA：占RNA總量的82%左右。