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布魯克和景杰生物：單細胞和空間蛋白質組技術推動精準醫療

2023.10.07

2023年9月24-27日，為促進蛋白質組學的研究和學科發展，增進國際間合作交流，由中國生物化學與分子生物學會蛋白質組學專業委員會（CNHUPO）主辦的第十二屆中國蛋白質組學大會在四川成都隆重召開。本次大會的主題是“人體蛋白質組的導航者（π-HuB項目）：通往智慧醫學之路”。大會聚焦蛋白質組學的最新進展，超過十多位院士、1700名國內外專業學者及45家廠商參與本次盛會。會議期間，布魯克和景杰生物聯合舉辦了“單細胞和空間蛋白質組技術與精準醫療衛星會”。此次會議邀請了澳大利亞莫納什生物醫學發現研究所教授 Anthony Purcell，景杰生物市場總監翁葉靖博士以及布魯克生命科學質譜中國區蛋白質組學應用主管杜瀟賢等嘉賓，圍繞單細胞蛋白質組學應用領域的深入研究做出精彩的演講，幾位嘉賓的專業分享獲得了現場參會的廣大學者朋友們的熱情提問與點贊。

第十二屆CNHUPO大會現場盛況

布魯克衛星會現場

澳大利亞莫納什生物醫學發現研究所教授 Anthony Purcell

報告題目：《Throughput without compromise in immunopeptidomics using timsTOF technology combined with EvoSep One（使用timsTOF技術與Evosep結合，無損檢測免疫肽組學）》

Anthony Purcell教授表示，免疫肽組學是指使用質譜研究主要組織相容性復合物（MHC）I類和II類分子所呈現的免疫肽的組成和動力學的科學，它可以大規模、深入識別和量化所呈現的HLA免疫肽組，是快速推進癌癥免疫療法的重要方法。這些抗原肽來自于細胞內和細胞外蛋白的降解，生成了高度復雜的肽配體庫，包括與病原體、組織特異性和癌癥特異性抗原相關的肽。在人類中，人類白細胞抗原（HLA）I類和II類分子對于免疫肽組學分析尤為重要。這些分子由多個基因編碼，構成了個體之間成千上萬不同的組成。由于免疫肽組是高度個體化的，幾乎不可能進行準確的預測，因此使用質譜分析來測量免疫肽組的復雜性和多樣性是必要的。對此，Anthony教授團隊利用高通量的Evosep平臺與布魯克timsTOF Pro 2相結合，用于在各種組織和細胞系中進行免疫肽組學的分析。能夠在保持數據質量和深度的同時，極大地降低樣品殘留，提升儀器有效使用時間，從而顯著提升通量。在過去的3個月，平均每月分析了超過400個免疫肽組學樣本，這為臨床免疫肽組學應用提供了解決方案。

景杰生物市場總監翁葉靖博士

報告題目：《The Application of Ultra-sensitive Proteomics in Precision Medicine（超靈敏度蛋白質組學在精準醫學中的應用）》

翁葉靖博士強調了單細胞分析的重要性以及景杰的超靈敏蛋白質組學技術如何幫助研究人員理解精細組織中蛋白質的功能。景杰生物推出了基于微流控的單細胞分選和前處理體系，其具有全自動化、無損處理、雙包率低、超高通量等特點，數據結果具有很好的穩定性和一致性，并可同時處理超過100個細胞，單細胞平均深度超過2000個蛋白。景杰生物的空間蛋白組技術平臺，基于組織切片、組織染色、LCM切割以及timsTOF HT質譜平臺，能在0.01 mm²×10 μm的常規組織樣本（約50~100個細胞）中，平均檢測大于4000個蛋白，可高精度高深度高重復性地呈現空間微尺度分子景觀。景杰生物單細胞和空間蛋白質組學技術的發展，極大的推動了人們在解析組織微環境、生物標記物開發、疾病診斷與預后等精準醫療領域更深的研究維度。

布魯克生命科學質譜中國區蛋白質組學應用主管杜瀟賢

報告題目：《Make the invisible visible timsTOF Ultra brings you to explore the micro universe of proteomics with unrivaled sensitivity（見所未見/布魯克最新timsTOF Ultra帶您探索蛋白質組學微觀宇宙）》

杜瀟賢主管報告了timsTOF Ultra在微量樣本分析中的應用。該平臺采用最新渦流設計的電噴霧離子源（CaptiveSpray Ultra )、第4代TIMS（捕集離子淌度）XR淌度池和14位數模轉換器。timsTOF Ultra可以在125pg k562進樣量的單細胞水平上鑒定超過55000條肽段，對應超過5500種蛋白質（FDR<1%），低于1ng蛋白進樣量的突破性靈敏度和定量性能為蛋白質組學研究建立了一個新標準。Bruker ProteoScape^?是布魯克推出的基于GPU的綜合蛋白質組學軟件，以CCS為中心進行信息學優化，現在自帶BPS Novor模塊，用于免疫肽組學的從頭測序，能全方位助力數據分析。

隨后杜瀟賢主管還介紹了布魯克的可復制單細胞蛋白質組學解決方案，布魯克公司在第一代“真”單細胞蛋白質組學質譜timsTOF SCP上積累的寶貴經驗和技術，在第二代timsTOF Ultra上得到了完全釋放。布魯克上海demo中心通過CellenOne對293T細胞進行分選，獲取單細胞，采用dia-PASEF^?方法進行數據采集，15min分析時長，單個293T細胞蛋白鑒定量突破4000大關；而且1個293T細胞兩次重復所鑒定的蛋白質強度相關系數>0.95，顯示出低至1個細胞的進樣量也能得到高重復性。timsTOF Ultra在探索單細胞樣本的同時也可以兼顧高通量分析，僅15ng的HeLa細胞消化液進樣量，8min分析時長，就可以鑒定到超過8300個蛋白質, 同時兼顧超高靈敏度與高通量分析，將推動空間蛋白質組學發展。

演講總結了timsTOF Ultra平臺的主要特點，包括高靈敏度、高通量、超快掃描速度以及適應不同樣本類型的能力。突出了布魯克在蛋白質組學領域的技術創新和在微量樣本分析中的應用前景。